Hydrológia

    Územie Kojšovskej holi patrí do povodia riek Hornád a Bodva. Severozápad územia odvodňuje potok Tokáreň, ktorý sa vlieva do Perlového potoka, ten následne do Hnilca a ten do Hornádu. Severovýchodná časť odvodňuje Kojšovský potok, ktorý sa vlieva do Hnilca. Južnú časť odvodňuje potok Ida, ktorý napája vodnú nádrž Bukovec, pokračuje smerom na juh a vlieva sa do rieky Bodva. Kojšovský potok má plochu v profile Kojšovská hoľa 1,30 km² a dlhodobý priemerný ročný prietok 0,015 m³.s^-1.

    Územie Kojšovskej holi leží podľa hydrogeologickej regionizácie Slovenska v hydrogeologickej regionizácie paleozoikum Slovenského Rudohoria v povodí rieky Hornád a paleozoikum Volovských vrchov v povodí rieky Bodvy. Na území v litologickej charakteristike hydrogeologického kolektora dominujú najmä matamorfity s veľmi nízkou charakteristikou priepustnosti a hydrogeologickej produktivity. Puklinová priepustnosť je dominantným typom. Geologická stavba územia neumožňuje väčie sústredenie podzemných vôd a bola narušená aj banskou činnosťou. V oblasti  sa nevyskytujú minerálne vody.